Товарищ Накамура, человек с портфелем (nakamura) wrote in fbb_msu,
Товарищ Накамура, человек с портфелем
nakamura
fbb_msu

Коллеги,

начиная с ближайшего вторника, 9 октября, на ФББ будет читаться факультативный курс лекций "Введение в эволюционную и медицинскую геномику". Лекции будут проходить по вторникам, в 17-30 в аудитории 406.

Формально это лекции для 4го курса, но приглашаются все интересующиеся.
Курс рассчитан на два семестра, программа под катом.



Программа курса «Введение в эволюционную и медицинскую геномику»

Георгий Александрович Базыкин (ИППИ РАН)
Василий Евгеньевич Раменский (ИМБ РАН)

Часть I (9 семестр, осень 2007)

  • Свидетельства в пользу эволюции. Модели эволюции последовательности. Гомология, матрицы замен.

  • Популяционная генетика. Отбор, фундаментальная теорема Фишера, типы отбора, доминирование

  • Популяционная генетика. Стохастические модели, генетика-автоматические процессы (дрейф); нейтральная теория, скорость и вероятность фиксации замен про отборе и дрейфе; мутационно-селекционно-дрейфовое равновесие

  • Популяционная генетика. Тесты отбора: dN/dS, тест Макдональда-Крейтмана, модель Голдмана-Янга. Демография, теория коалесценции.

  • Происхождение и элиминация вредных мутаций: мутационно-селективное равновесие и мутационный груз.


Часть II (10 семестр, весна 2008)

  • Полиморфизм генома человека. Однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) и мутации, их типы роль в формировании фенотипа.

  • Менделевские (моногенные) заболевания. Типы заболеваний, их молекулярные основы и методы исследований. Примеры.

  • Сложные (мультифакторные) заболевания. Особенности изучения таких заболеваний. Ассоциативные исследования. Гипотезы CD/CV и CD/RV. Примеры.

  • Предсказание эффекта мутаций с помощью вычислительных методов. Области применения.

  • Разработка лекарств. Основные требования к лекарствам (ADME). Поиск белков-мишеней и вычислительное конструирование ингибиторов. Задачи докинга, скрининга и оптимизации ингибиторов. Эффективность и селективность лекарственных препаратов.

  • Обсуждение дополнительных тем, журнальный клуб. Компенсаторная эволюция. «Медицина будущего»: новые типы лекарственных препаратов, индивидуальная медицина, генная терапия.



Литература

  1. М.Кимура. Молекулярная эволюция: теория нейтральности. Москва, «Мир», 1985.

  2. Дж. Мэйнард Смит. Эволюция полового размножения. Москва, «Мир», 1981

  3. Геномика – медицине. Сборник, ред.: В.И.Иванов, Л.Л.Киселев. Москва, «Академкнига», 2005

  4. И.В. Равич-Щербо и др. Психогенетика. Москва, Аспент-пресс, 2004

  5. J.H. Gillespie Population genetics: a concise guide. The Johns Hopkins University Press, 1998

  6. D. Graur, W.-H. Li . Fundamentals of molecular evolution. Sinauer Associates, Inc., 2000

  7. D.L.Hartl, A.G.Clark. Principles of population genetics. Sinauer Associates, Inc., 1997

  8. R.Lewis. Human genetics. Concepts and applications. The McGraw-Hill Companies, 2003

  9. G.Thomas. Fundamentals of medicinal chemistry. John Wiley & Sons, 2003

Subscribe
  • Post a new comment

    Error

    default userpic

    Your IP address will be recorded 

    When you submit the form an invisible reCAPTCHA check will be performed.
    You must follow the Privacy Policy and Google Terms of use.
  • 3 comments