Товарищ Накамура, человек с портфелем (nakamura) wrote in fbb_msu,
Товарищ Накамура, человек с портфелем
nakamura
fbb_msu

Коллеги,

начиная с ближайшего вторника, 9 октября, на ФББ будет читаться факультативный курс лекций "Введение в эволюционную и медицинскую геномику". Лекции будут проходить по вторникам, в 17-30 в аудитории 406.

Формально это лекции для 4го курса, но приглашаются все интересующиеся.
Курс рассчитан на два семестра, программа под катом.



Программа курса «Введение в эволюционную и медицинскую геномику»

Георгий Александрович Базыкин (ИППИ РАН)
Василий Евгеньевич Раменский (ИМБ РАН)

Часть I (9 семестр, осень 2007)

  • Свидетельства в пользу эволюции. Модели эволюции последовательности. Гомология, матрицы замен.

  • Популяционная генетика. Отбор, фундаментальная теорема Фишера, типы отбора, доминирование

  • Популяционная генетика. Стохастические модели, генетика-автоматические процессы (дрейф); нейтральная теория, скорость и вероятность фиксации замен про отборе и дрейфе; мутационно-селекционно-дрейфовое равновесие

  • Популяционная генетика. Тесты отбора: dN/dS, тест Макдональда-Крейтмана, модель Голдмана-Янга. Демография, теория коалесценции.

  • Происхождение и элиминация вредных мутаций: мутационно-селективное равновесие и мутационный груз.


Часть II (10 семестр, весна 2008)

  • Полиморфизм генома человека. Однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) и мутации, их типы роль в формировании фенотипа.

  • Менделевские (моногенные) заболевания. Типы заболеваний, их молекулярные основы и методы исследований. Примеры.

  • Сложные (мультифакторные) заболевания. Особенности изучения таких заболеваний. Ассоциативные исследования. Гипотезы CD/CV и CD/RV. Примеры.

  • Предсказание эффекта мутаций с помощью вычислительных методов. Области применения.

  • Разработка лекарств. Основные требования к лекарствам (ADME). Поиск белков-мишеней и вычислительное конструирование ингибиторов. Задачи докинга, скрининга и оптимизации ингибиторов. Эффективность и селективность лекарственных препаратов.

  • Обсуждение дополнительных тем, журнальный клуб. Компенсаторная эволюция. «Медицина будущего»: новые типы лекарственных препаратов, индивидуальная медицина, генная терапия.



Литература

  1. М.Кимура. Молекулярная эволюция: теория нейтральности. Москва, «Мир», 1985.

  2. Дж. Мэйнард Смит. Эволюция полового размножения. Москва, «Мир», 1981

  3. Геномика – медицине. Сборник, ред.: В.И.Иванов, Л.Л.Киселев. Москва, «Академкнига», 2005

  4. И.В. Равич-Щербо и др. Психогенетика. Москва, Аспент-пресс, 2004

  5. J.H. Gillespie Population genetics: a concise guide. The Johns Hopkins University Press, 1998

  6. D. Graur, W.-H. Li . Fundamentals of molecular evolution. Sinauer Associates, Inc., 2000

  7. D.L.Hartl, A.G.Clark. Principles of population genetics. Sinauer Associates, Inc., 1997

  8. R.Lewis. Human genetics. Concepts and applications. The McGraw-Hill Companies, 2003

  9. G.Thomas. Fundamentals of medicinal chemistry. John Wiley & Sons, 2003

Subscribe
  • Post a new comment

    Error

    default userpic

    Your IP address will be recorded 

  • 3 comments